<?xml version="1.0" encoding="ASCII"?>
<biogps><data><item key="owner">ArrayExpress Uploader</item><item key="ownerprofile_id">arrayexpress_sid</item><item key="species">human</item><item key="factors"><item><item key="GSM930574"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">49</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IV</item></item></item><item><item key="GSM930573"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">62</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930572"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">24</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM93057"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">54</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930570"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">72</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIB</item></item></item><item><item key="GSM930569"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">55</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930568"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">61</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930567"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">48</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930566"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">39</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930565"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">50</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930564"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">44</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930563"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">51</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIB</item></item></item><item><item key="GSM930562"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">61</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIB</item></item></item><item><item key="GSM93056"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">30</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIB</item></item></item><item><item key="GSM930560"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">52</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930559"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">69</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930558"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">56</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930557"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">73</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930556"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">47</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930555"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">41</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930554"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">49</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930553"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">28</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIIB</item></item></item><item><item key="GSM930552"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">57</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">RD</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM93055"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">46</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930550"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">30</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">not specified</item></item></item><item><item key="GSM930549"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">65</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIB</item></item></item><item><item key="GSM930548"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">52</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIB</item></item></item><item><item key="GSM930547"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">56</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIB</item></item></item><item><item key="GSM93055"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">46</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930545"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">56</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930544"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">53</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIB</item></item></item><item><item key="GSM930543"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">62</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930542"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">55</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM93054"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">51</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIB</item></item></item><item><item key="GSM930540"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">53</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930539"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">41</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930538"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">50</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930537"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">63</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930536"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">38</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">I</item></item></item><item><item key="GSM930535"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">43</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930534"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">51</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930533"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">45</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIC</item></item></item><item><item key="GSM930532"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">56</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM93053"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">47</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930530"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">36</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">I</item></item></item><item><item key="GSM930529"><item key="PR">POS</item><item key="AGE">38</item><item key="ER">POS</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930528"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">30</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIA</item></item></item><item><item key="GSM930527"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">52</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIIB</item></item></item><item><item key="GSM930526"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">34</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item><item><item key="GSM930525"><item key="PR">NEG</item><item key="AGE">50</item><item key="ER">NEG</item><item key="RESPONSE">PCR</item><item key="STAGE">IIA</item></item></item></item><item key="id">1245</item><item key="pop_total">0</item><item key="platform">3</item><item key="summary_wrapped">We identified a 17-gene Her2-enriched tumor initiating cell (HTIC) signature in MMTV-Her2/Neu mouse mammary TICs. Here, we show that...</item><item key="geo_gse_id">E-GEOD-37946</item><item key="owner_profile">/profile/8773/arrayexpressuploader</item><item key="factor_count">5</item><item key="sample_count">50</item><item key="tags"><item>breast</item><item>breast cancer</item><item>cancer</item><item>cell</item></item><item key="lastmodified">Dec.12, 2014</item><item key="is_default">False</item><item key="geo_id_plat">E-GEOD-37946_A-AFFY-33</item><item key="slug">her2-enriched-tumor-initiating-cell-htic-genomic-p</item><item key="geo_gds_id"/><item key="name">HER2-enriched tumor initiating cell (HTIC) genomic predictor of response following neoadjuvant trastuzumab-based chemotherapy in HER2+ breast cancer</item><item key="created">Jun.18, 2014</item><item key="summary">We identified a 17-gene Her2-enriched tumor initiating cell (HTIC) signature in MMTV-Her2/Neu mouse mammary TICs. Here, we show that patients with HTICS+ HER2+:ER&#945;&#8722; tumors are more likely to achieve a pathologic complete response to trastuzumab-based neoadjuvant chemotherapy compared with HER2+:ER+ tumors. Neoadjuvant study of 50 HER2-positive breast cancer cases treated with trastuzumab-based chemotherapy pre-operatively. Pre-treatment FNA from primary tumors were obtained and RNA extracted and hybridized to Affymetrix microarrays according to manufacturer protocol. Pathologic response was assessed at the end of neoadjuvant treatment.</item><item key="source">http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-37946</item><item key="sample_source">http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-37946/samples/</item></data></biogps>
