<?xml version="1.0" encoding="ASCII"?>
<biogps><data><item key="owner">ArrayExpress Uploader</item><item key="ownerprofile_id">arrayexpress_sid</item><item key="id">4055</item><item key="factors"><item><item key="GSM71080"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710802"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710803"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Descending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710804"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Transverse</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710802"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710806"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Cecum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710807"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710802"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710802"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710810"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710810"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710802"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710813"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Peritoneum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710814"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710814"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710813"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Peritoneum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710813"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Peritoneum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM71080"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710814"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM71080"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710802"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710807"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710807"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710810"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710825"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710825"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710827"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710828"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710830"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM71083"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Cecum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710832"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710832"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710832"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710830"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710836"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710830"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710845"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">lung</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710828"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710828"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710829"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710862"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710830"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710862"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710867"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710862"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710830"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710830"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">training</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710875"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710877"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710879"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM71088"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710883"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710877"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710886"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Descending</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710888"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710888"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710875"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710879"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710875"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710879"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710900"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Cecum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710902"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710905"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710906"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710908"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM7109"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710913"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710913"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710916"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710916"><item key="LESION">Metastasis</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">liver</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710908"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">rectum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710906"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710924"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710926"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Cecum</item><item key="SEX">F</item></item></item><item><item key="GSM710906"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Sigmoid</item><item key="SEX">M</item></item></item><item><item key="GSM710930"><item key="LESION">Primary</item><item key="MFOLFOX6">non-responder</item><item key="TYPE">test</item><item key="LOCATION">Ascending</item><item key="SEX">M</item></item></item></item><item key="pop_total">0</item><item key="platform">4</item><item key="summary_wrapped">The aim of this study is to identify responders to FOLFOX therapy by applying the Random Forests (RF) algorithm to gene expression data....</item><item key="pubmed_id">22095227</item><item key="owner_profile">/profile/8773/arrayexpressuploader</item><item key="factor_count">5</item><item key="sample_count">83</item><item key="tags"><item>cancer</item><item>colorectal cancer</item></item><item key="lastmodified">Dec.12, 2014</item><item key="is_default">False</item><item key="geo_id_plat">E-GEOD-28702_A-AFFY-44</item><item key="slug">crc-samples-for-folfox-therapy-prediction</item><item key="source">http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-28702</item><item key="geo_gds_id"/><item key="name">CRC samples for FOLFOX therapy prediction</item><item key="created">Sep.16, 2014</item><item key="summary">The aim of this study is to identify responders to FOLFOX therapy by applying the Random Forests (RF) algorithm to gene expression data. Eighty-three unresectable colorectal cancer (CRC) patients including 42 responders and 41 non-responders were divided into training (54 patients) and test (29 patients) sets. Samples were divided (approximately 2:1 ratio) into training and test sets. As a result, 54 of 83 samples obtained in the first half of this period were selected for the training set, and the remaining 29 samples in the latter half were selected as the test set.</item><item key="geo_gse_id">E-GEOD-28702</item><item key="species">human</item><item key="sample_source">http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-28702/samples/</item></data></biogps>
